一、園區發展組
策略規劃
• 園區(含工業專用港)發展策略之規劃。
• 園區開發及更新策略之企劃。
• 年度施政方針與施政計畫之研擬、協調、及管制考核及施政成果彙整。
• 國會與媒體公關事務之規劃及推動。

計畫管理
• 園區服務效能與創新服務之規劃及推動。
• 院、部、自行管制計畫之管制考核與重要會議及活動計畫表。
• 部務會議報告、管制資料之彙整。
• 出國報告、人民陳情(含首長信箱)案件、列管案件及專人專線等業務之追蹤管制。

法務業務
• 園區法規之制(訂)定、修正、解釋之擬議。
• 園區法律案件之審議、協辦。
• 園區涉及法律爭議案件之處理。
• 園區法規資料之蒐集整編及主管法規系統之通報事項。

二、開發營建組
開發規劃
• 園區(含工業專用港)設置與用地變更計畫之研擬、審查及推動。
• 園區編定、變更、廢止之審查及輔導。
• 園區環境影響評估及差異分析之研擬。

產業用地
• 園區土地、建物之取得、租售、管理機制之訂定。
• 園區開發成本之認定、查核、結算。
• 園區私有廠房出租售及轉讓報備。
• 園區土地管理法規之研擬。

開發工程
• 園區開發計畫之執行及工程督導。
• 園區更新計畫之研擬及工程督導。
• 園區一般公共設施之維護督導。
• 園區公共管線地理資訊系統建置計畫研擬。
• 科技產業園區建築管理業務之督導及執行。

三、投資服務組
投資促進
• 園區整體招商投資策略與服務之規劃及推動。
• 園區投資招商協調及投資障礙排除。
• 園區投資事業審查事宜。
• 園區投資與貿易業務之研議、統計分析及調查考核事項。

經營輔導
• 園區國際合作、工商團體業務之協調聯繫及輔導。
• 科技產業園區關務、保稅業務之規劃、推動、協調及執行。
• 科技產業園區貿易、工商業務之規劃及推動。
•產業升級轉型需求體系輔導及對外貿易發展業務之規劃。

創新發展
• 園區產業聚落、創新研發及提升產業附加價值之規劃及推動。
• 園區人才培育發展、產學合作及有助推動產業發展之規劃及推動。
• 園區廠商聯誼會、廠商協進會之協調、聯繫與輔導事項。
• 財團法人業務及科技產業園區內產業同業公會業務之監督事項。
• 各產業之中央目的事業主管機關及地方機關推動產業發展協助事項。

四、營運管理組
綜合管理
• 園區(含工業專用港)營運管理之規劃及推動。
• 園區電力、電信、自來水與其他公用事業之協調。
• 科技產業園區警察、保全、交通、消防、衛生保健、環境清潔與其他公共福利事項之督導、協調及執行。
• 園區管理機構及作業單位業務之訂定、督導與考核。

財務管理
• 園區基金財務之規劃、管理及資金調度。
• 產業園區一般公共設施維護費率及出租費率之審核、擬定及執行。
• 科技產業園區管理費、土地租金與公共設施建設費計收標準之擬定、執行、收取並編製統計清冊。
• 基金轉投資股東相關會議議題彙整。

資訊
• 園區資通訊系統之規劃、建置及管理。
• 園區資料應用業務與服務之協調、推動事項。
• 園區資通訊安全之規劃、推動、執行、維運管理及督導事項。

五、環安勞動組
環境管理
• 園區水污染防治之規劃、推動及督導。
• 園區污水下水道系統之規劃、推動、督導及使用費費率審核。
• 園區土壤與地下水污染防治之規劃、推動及督導。
• 園區廢棄物清理之規劃、推動及督導。

永續發展
• 園區環境影響評估後續追蹤之督導。
• 園區節能減碳、節水與用水回收利用之規劃、推動及督導。
• 園區永續促進之規劃、推動及督導。
• 園區綠色議題、環境教育之規劃、推動及督導。
• 科技產業園區空氣污染防制、許可與事業廢棄物管理及清理計畫書之審查。

工安勞動
• 園區工安通報(含天然災害)與區域聯防體系之規畫、推動及督導。
• 園區職業安全衛生相關業務之輔導。
• 園區勞工法令宣導之規劃、推動及督導。
• 科技產業園區勞動檢查及勞工行政業務之規劃、推動、督導及執行。
• 科技產業園區勞工團體補助業務之推動、督導。